تابعة لقسم الرقابة والتدقيق الداخلي في الرئاسة ويتم تكليف المدققين بمهام التدقيق في الكليات وآلية العمل تكون:
1-تدقيق المعاملات المالية إبتداءاً من طلب الحاجة من الأقسام والشعب وشراء المواد حسب التعليمات والموازنة المخصصة لكل كلية وتدقيق جميع وصولات القبض والمستندات والسجلات اليومية والمقبوضات والمدفوعات وغيرها وميزان المراجعة الشهري.
2-تدقيق الأضابير والتأكد من الأوامر الجامعية والأدارية والوثيقة وصحة صدورها وغيرها من المستمسكات الضرورية.
3-الزيارات الدورية أو نصف الدورية للمكتبة والمجانية والتسجيل والمخزن والصيانة وذلك لأجل المطابقة مع ماموجود بالمكتبة أو المجانية.
4-تدقيق المخازن من حيث تدقيق سجلات الأجهزة والأثاث ومطابقة ماموجود والجرد المفاجئ للمخزن وغيرها من السجلات الفرعية.
5-تدقيق المحاضرات وفق الأوامر الأدارية والتأكد من إكمال النصاب للتدريسيين.
6-تنبيه جميع الأقسام إلتزام التعليمات وإبداء النصح والمشورة وذلك لعدم الوقوع في مخالفات قانونية خدمة للصالح العام.
7-كتابة التقارير الشهرية لمدير قسم الرقابة للإطلاع على الموقف وإبداء الرأي والمشورة القانونية للمعاملات التي تحتاج الى مشورة قانونية.